很久以前，神宫皇后从三官征战归来时，在濑户内海遭遇了狂风暴雨。 当船快要沉没的时候，皇后向上帝祈祷，上帝传来消息说：“把船的帆投进海里，船就会朝着它该去的方向行驶。” 皇后按照吩咐来到了一个名叫友岛的岛屿。岛上供奉着数彦命和近江高野命，皇后献上战利品以感谢他们的救命之恩。 几年后，皇后的孙子仁德天皇在友岛打猎时听到了这个故事。因此，为了避免给岛民带来不便，神社从岛上迁至街对面的加太，并建了一座寺庙。这就是加太淡岛神社的由来。